Существует несколько версий происхождения названия:
Академик А. М. Шёгрен производит название озера от фин. aani — звук, голос, отсюда — «звучащее („шумливое“) озеро».
А. Л. Погодин расшифровывает данный топоним от саам. agne — «песок» + jegge — «низменная равнина».
Профессор, доктор филологических наук И. И. Муллонен считает, что название озера могло произойти от саам. ane и прибалтийско-финского anine/aniz, что означает «большой, значительный».
Есть также предположение, что название озера имеет северогерманское происхождение (ср. др.-исл. anegja «удовольствие, удовлетворение»).